also früher haben mkv auch öfters geruckelt... seit ich den neuen Laptop hab nicht mehr
kann dir auch empfehlen, ein addon für den Windows Media Player installieren.. der spielt die super ab

zu dem umformatieren... musste nix löschen und es gehen normalerweise keine Daten verloren
kannst bequem per cmd.exe
hier ein Bsp. http://www.alterfalter.de/fat32-ohne...umformatieren/

oder einfach google suche