Warum fragst du nicht Google? Google weiß bescheid.

Also das ist bei jedem Protein anders: Whey wird zumeist durch mechanische Filtration hergestellt (bei ultra-/mikrofiltriertem Whey).
Soja wird erst entfettet, mit Wasser vermischt, das Protein wird mit Säure ausgefällt und dann mit Lauge neutralisiert.
Beim Reis wird die Stärke enzymatisch abgebaut und die resultierenden Zucker sind wasserlöslich, das Protein aber nicht usw. Halt je nach Eigenschaft des Proteins, bzw der Quelle.