Zum Beispiel trainiere ich Beine/Brust/Trizeps: Könnte ich dann beispielsweise zunächst Kniebeugen, dann Bankdrücken, daraufhin Dips (mit Schwerpunkt Trizeps) machen und anschließend die Isos wie Beincurls, Trizepszug, Wadenheben? Oder schadet es, wenn die Muskeln eine so lange Pausen zwischen den Belastungen haben?
so lange du noch auf so einem niedriegem trainings/intensitätslevel rumwurschtelst isses völlig egal wie du trainierst.

ansonsten: schwere mehrgelenksübungen immer zuerst (oder gerade zuletzt) gefolgt von isos und cooldown. je besser dein trainingsstand wird, umso eher wirst du erkennen das man mit einer primären muskelgruppe pro training am besten beraten ist. jetzt machst du anscheinend noch einen ganzkörperplan. niemand hindert dich daran ihn so umzustellen das du besser damit zurecht kommst...