Es kann natürlich sein, dass der "Super Kniebeugen"-Effekt sich auch auf Deine Schultern auswirkt - aber wie Du schon schreibst: Ohne Überkopf-Drückübung würde ich auch nicht zu viel erwarten.

Passe den Plan doch an Deine Bedürfnisse an: Trainiere nach dem verkürzten Plan und ergänze ihn einfach um Military Press o.ä.